肠胃炎通常同时引起腹泻和呕吐。有时，只有一个或另一个存在。这可能伴有腹部绞痛。症状和体征通常在感染因子感染后12-72小时开始。如果是由于病毒，病情通常会在一周内消失。一些病毒感染还涉及发烧，疲劳，头痛和肌肉疼痛。如果大便带血，则病因不太可能是病毒，而更可能是细菌。一些细菌感染会导致严重的腹痛，并可能持续数周。

感染了轮状病毒的儿童通常会在三到八天内完全康复。然而，在贫穷国家中，严重感染的治疗常常无法实现，持续腹泻很普遍。 脱水是腹泻的常见并发症。如果按下时皮肤的颜色和位置恢复缓慢，则可能会发现儿童严重脱水。这被称为“ 毛细血管补充过长”和“ 皮肤膨松 ”。呼吸异常是严重脱水的另一个迹象。在卫生条件差的地区通常会出现重复感染，并且营养不良。 发育迟缓和长期的认知延迟可能会导致。

弯曲杆菌属感染后，有1％的人会发生反应性关节炎。 格林-巴雷综合征的发生率为0.1％。 溶血性尿毒症综合征（HUS）可以因感染发生志贺毒素产生性大肠杆菌或志贺氏菌属物种。 HUS导致血小板计数低，肾脏功能差和红细胞计数低（由于其分解）。儿童比成年人更容易患上HUS。一些病毒感染可能会产生婴儿良性癫痫发作。